* Focus sur la structure cellulaire : Le système des cinq règnes repose principalement sur des caractéristiques visibles telles que la structure cellulaire (par exemple, la présence d'un noyau) et le mode de nutrition. Ce système ne capture pas correctement la grande diversité et l’évolution des micro-organismes.
* Progrès en phylogénie : Grâce aux progrès des techniques moléculaires telles que le séquençage de l’ADN, nous avons découvert que de nombreux micro-organismes regroupés en fonction de caractéristiques externes sont en réalité assez éloignés.
* L'essor des domaines : Le système à trois domaines (bactéries, archées, eucaryas) est désormais largement accepté comme un reflet plus précis des relations évolutives.
Voici comment les cinq règnes sont liés à la microbiologie moderne :
* Monera (bactéries et archées) : Ce règne est le plus pertinent pour la microbiologie. Il regroupe la grande majorité des micro-organismes étudiés sur le terrain. Cependant, la classification moderne sépare les bactéries et les archées en domaines distincts.
* Protiste : Ce règne englobe un groupe diversifié d’organismes eucaryotes pour la plupart unicellulaires, notamment des algues, des protozoaires et des moisissures visqueuses. Certains protistes sont étudiés en microbiologie, notamment ceux qui provoquent des maladies ou ont une importance écologique.
* Champignons : Les champignons sont des organismes eucaryotes qui jouent un rôle crucial dans la décomposition et le cycle des nutriments. Si certains champignons sont macroscopiques, beaucoup sont microscopiques, ce qui les rend pertinents pour la microbiologie.
* Plantes et animaux : Ces règnes comprennent principalement les organismes multicellulaires et sont moins directement pertinents pour l'étude des micro-organismes. Cependant, les microbiologistes étudient les interactions entre les micro-organismes et les plantes et les animaux (par exemple, symbiose, maladie).
En substance :
* La microbiologie se concentre principalement sur les bactéries , Archées , et certains groupes de Protistes , et Champignons .
* Le système des cinq royaumes est obsolète et ne reflète pas avec précision les relations entre les micro-organismes.
* Le système à trois domaines fournit une image plus précise de l’histoire évolutive de la vie sur Terre.