Il existe quatre bases azotées différentes dans l'ADN:
* adénine (a)
* guanine (g)
* cytosine (c)
* thymine (t)
Ces bases s'associent d'une manière spécifique:l'adénine se marie toujours avec de la thymine (A-T), et la guanine se marie toujours avec de la cytosine (G-C). Ces paires sont maintenues ensemble par des liaisons hydrogène, formant les "échelons" de l'échelle d'ADN.
Les côtés de l'échelle sont constitués de molécules de sucre alternant (désoxyribose) et de phosphate.