1. Classification phylogénétique (basée sur les relations évolutives):

* séquençage du gène d'ARNr 16S: Cette méthode compare les séquences du gène de l'ARN ribosomal 16S, un gène hautement conservé présent dans tous les organismes vivants. Les différences dans la séquence des gènes révèlent des relations évolutives entre les archées.

* Autres marqueurs moléculaires: Les scientifiques utilisent également d'autres gènes, comme ceux impliqués dans le métabolisme énergétique, pour affiner davantage la classification.

2. Classification métabolique (basée sur les sources d'énergie et le métabolisme):

* méthanogènes: Produire du méthane comme sous-produit de leur métabolisme et se trouvent dans des environnements anaérobies.

* halophiles: Prospérer dans des environnements très salés comme les lacs de sel et les sel.

* thermophiles: Survivre dans des environnements extrêmement chauds comme les sources chaudes et les évents hydrothermaux.

* acidophiles: Préfèrent les environnements acides.

* alcalophiles: Prospérer dans les environnements alcalins.

3. Caractéristiques cellulaires:

* Composition de la paroi cellulaire: Les archées ont des parois cellulaires uniques différentes de celles des bactéries. Certaines archées ont des parois cellulaires composées de pseudopeptidoglycane ou même manquent complètement de parois cellulaires.

* Lipides membranaires: Les archées possèdent des lipides membranaires uniques différents de ceux des bactéries et des eucaryotes.

4. Facteurs environnementaux:

* Habitat: Les archées se trouvent dans un large éventail d'environnements, y compris des environnements extrêmes comme les sources chaudes, les lacs de sel et les évents en haute hauteère.

Le système de classification actuel pour Archaea reconnaît deux phyla principale:

* euryarchaeota: Comprend les méthanogènes, les halophiles et les thermophiles.

* Crenarchaeota: Contient de nombreux thermophiles et acidophiles.

D'autres phyla plus petits ont également été identifiés, notamment:

* thaumarchaeota

* nanoarchaeota

* Korarchaeota

* aigarchaeota

La classification des archées évolue constamment à mesure que de nouvelles espèces sont découvertes et que de nouvelles informations sont gagnées sur leurs relations évolutives et leurs capacités métaboliques.

Remarque: Le terme «archébactéries» est dépassé et n'est plus utilisé par les scientifiques. Le terme correct est archaea .