* bactéries: De nombreuses bactéries, en particulier celles vivant dans des environnements pauvres en oxygène, comptent sur la respiration anaérobie.
* Archaea: Comme les bactéries, certaines archées utilisent une respiration anaérobie pour générer de l'énergie.
* levure: La levure est un type de champignon qui peut effectuer une respiration aérobie et anaérobie, ce dernier connu sous le nom de fermentation.
* parasites: Certains organismes parasites, comme le ver rond parasite * Ascaris Lumbricoides *, utilisent la respiration anaérobie dans des environnements privés d'oxygène au sein de leurs hôtes.
* cellules musculaires (chez les animaux): Pendant un exercice intense, lorsque l'approvisionnement en oxygène est limité, les cellules musculaires peuvent passer à la respiration anaérobie (fermentation de l'acide lactique) pour produire de l'énergie.
Il est important de noter que si de nombreux organismes peuvent effectuer une respiration anaérobie, ce n'est pas leur principal mode de production d'énergie. La plupart des organismes préfèrent la respiration aérobie, ce qui est beaucoup plus efficace dans la production d'énergie.