1. Bactéries: Ce domaine comprend la plupart des procaryotes que nous connaissons, de ceux trouvés dans le sol et l'eau à ceux qui vivent dans des environnements extrêmes.

2. Archaea: Ce domaine se compose d'organismes unicellulaires qui ont été initialement classés comme bactéries mais qui sont maintenant reconnus comme distincts d'eux en raison de leur biochimie, de leur génétique et de leur physiologie uniques. De nombreuses archées prospèrent dans des environnements extrêmes comme les sources chaudes, les lacs de sel et les évents hydrothermaux.