1. Mur-cellule: Cette couche extérieure rigide offre une forme et une protection à la cellule. Il est fait de peptidoglycane, une molécule unique que l'on ne trouve que dans les bactéries. La structure de la paroi cellulaire est utilisée pour classer les bactéries en deux groupes principaux:Gram positif et Gram négatif.

2. ribosomes: Ceux-ci sont essentiels pour la synthèse des protéines. Les bactéries ont des ribosomes 70S, qui sont plus petits que les ribosomes des années 80 trouvés dans les cellules eucaryotes. Cette différence est importante pour le développement d'antibiotiques qui ciblent les ribosomes bactériens sans nuire aux cellules humaines.

Il existe de nombreuses autres structures importantes dans les bactéries, mais ces deux sont essentielles pour leur survie et leur fonction.