Facteurs internes:
* Séquence d'acides aminés: La structure primaire d'une enzyme, sa séquence d'acides aminés, dicte sa forme tridimensionnelle. Tout changement dans la séquence des acides aminés, en raison de mutations ou de variations génétiques, peut modifier la structure de l'enzyme et son activité.
* Obligations disulfure: Ces liaisons entre les résidus de cystéine peuvent stabiliser la structure tertiaire d'une enzyme. Les modifications du nombre ou de l'emplacement des liaisons disulfure peuvent affecter la forme de l'enzyme.
* liaisons hydrogène, interactions ioniques, interactions hydrophobes: Ces forces contribuent au repliement et à la stabilité de la structure des protéines. La perturbation de ces interactions peut modifier la forme de l'enzyme.
* Modifications post-traductionnelles: Les modifications après la synthèse des protéines, comme la phosphorylation ou la glycosylation, peuvent influencer la structure et l'activité de l'enzyme.
Facteurs externes:
* Température: Les enzymes ont une plage de température optimale pour l'activité. Les températures extrêmes peuvent perturber l'équilibre délicat des interactions tenant l'enzyme dans sa forme active, conduisant à la dénaturation (dépliage) et à la perte de fonction.
* pH: Chaque enzyme a une plage de pH optimale. La déviation de cette plage peut perturber les interactions ioniques et les liaisons hydrogène dans l'enzyme, modifiant sa structure et son activité.
* Concentration du substrat: Bien que la présence de substrat ne change pas la forme de l'enzyme, des concentrations élevées de substrat peuvent saturer l'enzyme, provoquant un changement dans sa forme globale.
* inhibiteurs: Les inhibiteurs compétitifs se lient au site actif d'une enzyme, empêchant la liaison du substrat et modifier sa forme. Les inhibiteurs non compétitifs se lient à un site différent de l'enzyme, provoquant un changement de conformation qui affecte le site actif.
* Activateurs: Certaines enzymes nécessitent des cofacteurs (molécules non protéiques) ou des coenzymes (molécules organiques) pour fonctionner. Ces molécules peuvent se lier à l'enzyme et induire un changement conformationnel, permettant une fonction appropriée.
* dénaturants: Ces agents, tels que des acides forts, des bases, des détergents ou des métaux lourds, perturbent les liaisons faibles qui maintiennent ensemble la structure de l'enzyme, conduisant à la dénaturation.
Il est important de se rappeler que la structure détermine la fonction dans les enzymes. Toute altération de la forme de l'enzyme peut affecter sa capacité à se lier à son substrat et à catalyser la réaction. Ce changement de forme peut entraîner une diminution de l'activité, une inactivation complète ou même un changement dans la spécificité de l'enzyme.
