Voici la principale différence:
* cellules eucaryotes ont un vrai noyau enfermé par une membrane, ainsi que d'autres organites liés à la membrane comme les mitochondries et l'appareil de Golgi.
* cellules procaryotes manque de noyau et d'autres organites liés à la membrane. Leur ADN est situé dans une région appelée nucléoïde, qui n'est pas enfermée par une membrane.
Les bactéries, ainsi que les archées, sont classées comme procaryotes.