Lorsqu'un champ électrique est appliqué, les particules chargées positivement (cations) dans le gel ou la membrane se déplaceront vers l'électrode négative (cathode), tandis que les particules chargées négativement (anions) se déplaceront vers l'électrode positive (anode). Ce mouvement de particules chargées crée une différence de pression osmotique entre les deux faces de la membrane. Le côté de la membrane qui contient la plus forte concentration de cations aura une pression osmotique plus élevée que le côté qui contient la plus forte concentration d’anions.
En raison de cette différence de pression osmotique, les molécules d’eau se déplaceront du côté de la membrane où la pression osmotique est la plus faible vers le côté où la pression osmotique est la plus élevée. Ce mouvement des molécules d’eau est appelé flux endosmotique.
Le flux endosmotique peut avoir plusieurs effets sur la séparation électrophorétique des particules chargées. Premièrement, cela peut amener les particules à se déplacer plus rapidement ou plus lentement qu’elles ne le feraient en l’absence de flux endosmotique. Deuxièmement, cela peut changer la direction du mouvement des particules. Troisièmement, les particules peuvent se propager plus ou moins qu’elles ne le feraient en l’absence de flux endosmotique.
Les effets du flux endosmotique sur la séparation électrophorétique peuvent être contrôlés en manipulant la composition du gel ou de la membrane et l'intensité du champ électrique.
