Il est difficile de distinguer avec précision les Protoceratops mâles et femelles uniquement sur la base de caractéristiques observables. Contrairement à certaines espèces où le dimorphisme sexuel est évident en termes de taille ou de caractéristiques physiques, les Protoceratops ne présentent pas de différences externes évidentes entre les sexes. Par conséquent, il peut être difficile de déterminer le sexe du Protoceratops sans une analyse scientifique approfondie.