1. Transmission maternelle :Lors de la naissance et au début de la vie, un animal acquiert une partie importante de son microbiome de sa mère. Cette transmission verticale se produit par diverses voies telles que le canal génital, le placenta et le lait maternel. Le microbiome maternel constitue la base initiale de l’établissement de la propre communauté microbienne de l’animal.
2. Exposition environnementale :Le milieu environnant influence fortement le développement du microbiome de l'animal. Des facteurs tels que le régime alimentaire, l’habitat, le type de sol et l’interaction avec d’autres animaux et humains contribuent à la diversité et à la composition du microbiome. Les animaux acquièrent des micro-organismes par exposition au sol, à l’eau, aux plantes et à d’autres animaux, conduisant à la colonisation et à l’établissement de diverses espèces microbiennes.
3. Facteurs génétiques et hôtes :Les facteurs génétiques, tels que la réponse immunitaire de l'animal, la physiologie intestinale et la composition du mucus, jouent un rôle dans la formation du microbiome. La constitution génétique de chaque animal influence la manière dont il interagit avec des micro-organismes spécifiques de l'environnement et les sélectionne. Cette interaction hôte-microbe est essentielle au maintien d’un microbiome équilibré et fonctionnel.
4. Emplacement géographique :La situation géographique peut avoir un impact significatif sur la composition du microbiome. Les animaux vivant dans différentes régions géographiques sont exposés à diverses communautés microbiennes, entraînant des variations dans la composition de leur microbiome. Des facteurs tels que le climat, l'altitude et le type d'écosystème contribuent à ces variations.
5. Interactions hôte-microbe :Le système immunitaire de l'animal interagit constamment avec le microbiome, influençant la composition et la dynamique de la communauté microbienne. Cette interaction hôte-microbe façonne l’équilibre entre les micro-organismes bénéfiques, commensaux et nocifs dans le microbiome, affectant la santé et le bien-être général de l’animal.
6. Changements au fil du temps :Le microbiome de l'animal n'est pas statique mais plutôt dynamique, subissant des modifications tout au long de la vie de l'animal. Des facteurs tels que le vieillissement, les modifications du régime alimentaire, les facteurs de stress environnementaux et l’exposition aux antibiotiques ou aux probiotiques peuvent influencer la composition du microbiome au fil du temps.
Il est important de noter que le débat entre nature et culture dans la formation du microbiome n’est pas un concept mutuellement exclusif. La nature (génétique et traits hérités) et l'éducation (facteurs environnementaux) interagissent de manière complexe pour déterminer l'établissement et la composition du microbiome d'un animal. Comprendre l'interaction entre ces facteurs est crucial pour étudier le rôle du microbiome dans la santé animale, l'écologie et l'évolution.
