Une équipe de scientifiques, comprenant des chercheurs de l'Université de Californie à San Francisco (UCSF), a utilisé des simulations sur ordinateur pour révéler comment la souche dominante du SRAS-CoV-2, connue sous le nom de D614G, se lie aux cellules hôtes humaines et est neutralisée par les anticorps.
La recherche, publiée dans la revue Nature Communications, fournit de nouvelles informations sur les mécanismes moléculaires qui sont à la base de l’infection et de l’immunité par le SRAS-CoV-2, ce qui pourrait faciliter le développement de vaccins et de traitements contre le COVID-19.
Utilisant le superordinateur Frontera financé par la National Science Foundation au Texas Advanced Computing Center (TACC), les chercheurs ont effectué des simulations approfondies des interactions entre la protéine de pointe D614G du SRAS-CoV-2 et les récepteurs de l'enzyme de conversion de l'angiotensine humaine 2 (ACE2), la principale porte d’entrée du virus pour pénétrer dans les cellules humaines.
Les simulations ont révélé que la mutation D614G améliore l’affinité de liaison entre la protéine de pointe et les récepteurs ACE2, expliquant le pouvoir infectieux accru de cette souche. Cette découverte suggère que la mutation D614G a joué un rôle crucial dans la propagation mondiale rapide du SRAS-CoV-2.
De plus, les simulations ont montré que la mutation D614G altère la conformation de la protéine Spike, la rendant plus susceptible à la neutralisation par certains anticorps. Cela laisse espérer que les anticorps et les vaccins existants ciblant la souche originale du SRAS-CoV-2 pourraient encore être efficaces contre la variante D614G.
Les résultats de cette étude mettent en valeur la puissance des simulations sur ordinateur pour comprendre les mécanismes moléculaires des infections virales et de l’immunité, et pourraient contribuer au développement de contre-mesures efficaces contre le COVID-19 et les futures pandémies.
"Nos simulations fournissent une compréhension détaillée au niveau moléculaire de la manière dont la mutation D614G affecte les interactions entre le SRAS-CoV-2 et les cellules humaines, ce qui pourrait guider la conception de vaccins et de traitements", a déclaré le Dr Jianhan Chen, chercheur postdoctoral et responsable de l'étude. à l'UCSF.
