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    Un nouvel outil d’IA capture le comportement des protéines dans leur contexte
    Un nouvel outil d’intelligence artificielle développé à l’Université de Californie à San Francisco (UCSF) peut capturer le comportement des protéines dans le contexte d’une cellule vivante. L’outil, appelé DeepTracer, utilise l’apprentissage en profondeur pour analyser de vastes ensembles de données d’images et de vidéos de protéines en action. Cela permet aux chercheurs de voir comment les protéines interagissent entre elles et avec leur environnement, et d'identifier les caractéristiques clés qui déterminent leur comportement.

    DeepTracer constitue une avancée significative par rapport aux méthodes existantes d’étude des protéines. Les méthodes traditionnelles, telles que la cristallographie aux rayons X et la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire, ne peuvent fournir que des images statiques des protéines. DeepTracer, quant à lui, peut capturer le comportement dynamique des protéines en temps réel. Cela permet aux chercheurs de voir comment les protéines changent de forme, se déplacent et interagissent avec d’autres molécules.

    DeepTracer est également un outil puissant pour la découverte de médicaments. En comprenant comment les protéines se comportent dans le contexte d’une cellule vivante, les chercheurs peuvent identifier de nouvelles cibles pour les médicaments et concevoir des médicaments plus efficaces et entraînant moins d’effets secondaires.

    "DeepTracer constitue une avancée majeure dans le domaine de la recherche sur les protéines", a déclaré le Dr Brian Chen, professeur de bio-ingénierie à l'UCSF et principal développeur de DeepTracer. "Cet outil permettra aux chercheurs d'étudier les protéines d'une manière qui n'a jamais été possible auparavant, et mènera à de nouvelles connaissances sur le fonctionnement des protéines et sur la manière dont elles peuvent être ciblées à des fins thérapeutiques."

    DeepTracer est décrit dans un article publié dans la revue Nature Methods. Le document est disponible en ligne sur https://www.nature.com/articles/s41592-022-01634-7.

    Le développement de DeepTracer a été soutenu par les National Institutes of Health, la National Science Foundation et le Howard Hughes Medical Institute.

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