L’industrie pomicole est confrontée au défi de l’uniformité génétique, avec quelques cultivars dominants réduisant la base génétique. Cette réduction de la diversité, exacerbée par les impacts imprévisibles du changement climatique sur la qualité et le rendement des fruits, souligne l'urgence d'élargir la diversité génétique au sein de la culture des pommes.
Il existe un besoin crucial de variétés de pommes capables de résister au stress environnemental tout en restant commercialement viables. Compte tenu de ces défis, une exploration approfondie des déterminants génétiques des caractères essentiels de la pomme, en particulier la taille et la forme du fruit, est essentielle.
Des recherches récentes du Centre de recherche en génomique agricole (CRAG) ont fait progresser leur compréhension de la génétique des pommes. Leur étude, publiée le 19 décembre 2023 dans Horticulture Research , a appliqué une analyse génomique robuste pour identifier les gènes liés à la taille et à la forme des pommes.
Cette étude se penche sur les fondements génomiques de la taille et de la forme des pommes, en utilisant un vaste ensemble de données englobant 355 génotypes de pommes du REFPOP (une collection européenne de 534 génotypes (accessions et descendances) qui représentent le matériel génétique de sélection européen actuel.
Grâce à l'association pangénomique (GWAS), l'équipe de recherche a identifié 59 polymorphismes mononucléotidiques (SNP) liés à ces traits, révélant 71 nucléotides de traits quantitatifs (QTN) répartis sur les chromosomes, à l'exclusion des chromosomes 10 et 15. La découverte de 34 QTN L'influence sur la taille et la forme a jeté un nouvel éclairage sur les subtilités génétiques régissant ces traits.
L'étude a particulièrement mis en lumière des gènes tels que MdOFP17 et MdOFP4, qui présentent des niveaux d'expression variés dans des cultivars présentant différentes formes de fruits, indiquant leur rôle crucial dans le développement des fruits. L'analyse des données d'ARN-seq confirme en outre le rôle de ces gènes dans la régulation de la forme, fournissant une lentille génétique à travers laquelle observer la diversité phénotypique parmi les cultivars de pommiers.
L'examen approfondi de l'étude sur le cadre génétique des caractéristiques des pommes a non seulement enrichi la compréhension scientifique, mais a également présenté des marqueurs génétiques tangibles qui pourraient affiner et accélérer le processus de sélection des pommes.
Le Dr Maria José Aranzana, l'auteur correspondant de l'étude, souligne :« Nos résultats ont ouvert la voie à une approche plus ciblée de la sélection des pommes, en se concentrant non seulement sur l'amélioration du rendement et de la résistance aux maladies, mais également sur la satisfaction des préférences des consommateurs pour des attributs spécifiques des fruits. comme la taille et la forme."
L’identification de ces marqueurs génétiques pourrait révolutionner la sélection des pommes, permettant le développement de nouvelles variétés alliant attrait visuel et capacité à s’adapter à divers climats et à résister aux maladies. Ces connaissances génétiques ont le potentiel d’orienter la production de pommes vers une plus grande durabilité et pourraient modifier considérablement le paysage de l’industrie pomicole.
Plus d'informations : Christian Dujak et al, Analyse génomique des caractères de taille et de forme des fruits chez la pomme :dévoilement de gènes candidats grâce à l'analyse GWAS, Recherche horticole (2023). DOI : 10.1093/hr/uhad270
Informations sur le journal : Recherche horticole
Fourni par TranSpread