Un nouveau champignon du bananier se propage rapidement à travers le monde. Il a frappé l'Afrique il y a dix ans, et la progression de la maladie constitue une menace pour la sécurité alimentaire de l'Afrique, révèle une étude génétique menée par l'Université et la recherche de Wageningen (WUR) et l'Université d'Utrecht. Le professeur de pathologie végétale Gert Kema et ses collègues tirent la sonnette d'alarme.

La fusariose progresse au Mozambique, où la souche dominante TR4 affecte les producteurs de bananes. Mais ce n'est pas le seul pays touché; au cours de la dernière décennie, la maladie s'est propagée de l'Asie à l'Amérique du Sud et à l'Afrique. Suite aux premiers signalements du Mozambique en 2013, aucun autre signalement n'a été fait pendant de nombreuses années. "La maladie semblait être sous contrôle en Afrique. Cependant, nous avons appris depuis que ce n'est malheureusement pas le cas", soupire Gert Kema, qui dirige le laboratoire de phytopathologie.

La nouvelle étude, menée par le Ph.D. de Kema. L'étudiante Anouk van Westerhoven et le spécialiste de la bioinformatique et des données Michael Seidl de l'Université d'Utrecht, en collaboration avec un chercheur local, montrent que le champignon TR4 s'est propagé jusqu'à au moins 200 kilomètres de la plantation d'origine. La recherche génétique montre que les souches trouvées dans différents endroits sont étroitement liées, ce qui signifie que l'agent pathogène trouvé au Mozambique a une origine unique.

Se propager à travers l'Afrique

"Cette première épidémie n'a finalement pas été maîtrisée. La maladie continue de se propager, y compris parmi les petits agriculteurs et les personnes ayant des bananiers dans leurs jardins. Ils ne reconnaissent probablement pas la maladie et, par conséquent, sont incapables de la traiter de manière adéquate. ", déclare Van Westerhoven.

"La question n'est pas de savoir si, mais plutôt quand, la maladie se propagera à d'autres pays africains", déclare-t-elle. Dans des pays comme la Tanzanie, le Malawi, l'Ouganda et le Ruanda, les bananes sont un aliment de base pour des millions de personnes. Ils cultivent souvent la banane Cavendish qui est vendue dans les supermarchés du monde entier, mais souvent aussi des souches de bananes locales. "La sensibilité ou non au TR4 n'est pas connue pour toutes les souches. Cette maladie menace donc la sécurité alimentaire dans ces pays", prévient Kema.

Nouvelle souche, ancienne maladie

L'attente de Kema est basée sur des expériences passées. Le champignon Fusarium est bien connu dans le monde des producteurs de bananes. Dans les années vingt, trente et quarante du siècle dernier, la maladie de Panama a fait des ravages dans toute l'Amérique latine. Cette maladie était causée par différents champignons Fusarium, et sa destruction a finalement été stoppée lorsque les agriculteurs ont commencé à cultiver la banane Cavendish résistante.

Le Cavendish domine actuellement le marché mondial. TR4 est une nouvelle espèce de Fusarium qui affecte cette variété et de nombreuses autres variétés de bananes. Le fait que cela soit largement inconnu en ce qui concerne les espèces de bananes africaines près de dix ans après la première apparition de TR4 au Mozambique est "inconcevable", déclare Kema.

Transféré par les humains, les voitures et l'eau

Avec des plantations partout où poussent la même banane, la maladie se propage rapidement. "C'est un champignon du sol", explique Kema.

"Les inondations aident énormément à la propagation. De plus, le champignon peut être transféré par des outils contaminés, de la terre transportée sur des chaussures et des pneus de voiture. Le trafic est abondant dans les plantations et les bananes sont cueillies à la main. Cela rend difficile le contrôle d'un tel champignon. . Lors de l'épidémie du siècle dernier, tous les efforts se sont avérés vains."

Culturer des variétés alternatives

« Notre première priorité est de découvrir quelles variétés sont sensibles et lesquelles ne le sont pas », poursuit Kema. « Une approche proactive. Dès que TR4 apparaît quelque part, tous les efforts imaginables doivent être faits pour contenir l'épidémie. De plus, il faut savoir quelles variétés peuvent encore être cultivées. La solution ultime réside dans de nouvelles variétés résistantes. ce qui est un processus qui prend du temps."

WUR et son partenaire KeyGene sont impliqués dans une vaste initiative de sélection en Afrique de l'Est. « Mais nous avons également commencé à sélectionner nos propres variétés en collaboration avec Chiquita. Cet effort se concentre sur la diversification des variétés pour le commerce d'exportation. Cependant, les connaissances acquises seront également utilisées pour sélectionner des variétés locales pour les marchés intérieurs », explique Kema.

Il fait référence à une étude publiée dans PLoS One cette semaine. Auteur principal, le Dr Fernando Garcia-Bastidas, sélectionneur de bananes chez Keygene et précédemment Ph.D. étudiant dans l'équipe de Kema, dit "nous avons découvert comment déclencher une réponse immunitaire à Cavendish en utilisant une souche de Fusarium avirulente". Des recherches supplémentaires sont nécessaires, mais la compréhension de ce phénomène peut contribuer à des solutions futures."

Inquiétudes concernant la sécurité alimentaire en Afrique

Kema dit qu'"à terme, d'autres bananes seront vendues sur les marchés européens. Mais ma plus grande préoccupation n'est pas de savoir si les consommateurs occidentaux pourront manger des bananes à l'avenir. Il s'agit de la sécurité alimentaire en Afrique. C'est ce qui nous inquiète maintenant que ce champignon se propage si facilement."

La recherche est publiée dans PLOS Pathogens et Maladie des plantes . + Explorer plus loin

Une manière possible de conférer une résistance aux champignons TR4 aux bananes Cavendish