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    L'outil eDNA détecte les palourdes envahissantes avant qu'elles ne deviennent une nuisance

    Eric Larson, écologiste aquatique de l'Université de l'Illinois, détient une poignée de plantes envahissantes Corbicula palourdes. Crédit :Université de l'Illinois

    Lorsqu'on cherche à guérir une maladie, la détection précoce est souvent la clé. Il en est de même pour l'élimination des espèces envahissantes. Identifier leur présence dans un lac avant qu'ils ne soient abondants est vital. Une étude récente de l'Université de l'Illinois a utilisé avec succès l'ADN environnemental pour détecter les palourdes envahissantes dans les lacs de Californie et du Nevada. Les chercheurs pensent que cet outil peut aider à identifier les parasites avant qu'ils ne deviennent un problème.

    « ADN environnemental, ou eDNA, signifie que nous trouvons l'ADN d'un animal ou d'une plante que nous recherchons à partir d'un échantillon environnemental, comme l'eau, ", explique Eric Larson, écologiste aquatique de l'Université de l'Ile. C'est un outil émergent qui a le potentiel d'être meilleur pour détecter les espèces rares dans certains cas, par rapport à certaines de nos méthodes d'enquête plus traditionnelles. Il y a beaucoup d'ADN flottant dans un lac ou un ruisseau, et si nous pouvons le capturer et l'identifier, il peut nous dire quels organismes sont présents, y compris les espèces envahissantes.

    Larson et ses collègues de l'Université Rice, l'Université de Notre-Dame, et l'Université du Nevada à Reno a développé un type d'analyse de laboratoire appelé test eDNA pour tester la présence de Corbicula , une palourde d'eau douce envahissante. Larson dit, "Nous avons trouvé l'ADNe pour Corbicula dans quatre des 11 lacs où nous savions déjà qu'il existait, y compris le lac Tahoe, et n'a pas trouvé d'ADNe de palourde dans sept autres lacs où il n'avait jamais été trouvé. L'emplacement de Corbicula L'ADNe dans le lac Tahoe correspondait également étroitement à l'endroit où nous savons que les palourdes se trouvent. Ces résultats ont donc confirmé que le test fonctionne bien, et qu'il pourrait être utile pour surveiller les nouvelles populations de cet envahisseur alors qu'il continue de se propager."

    Larson dit Corbicula est très répandu en Europe et aux États-Unis mais ils ne sont pas encore partout. Les palourdes, qui sont originaires d'Asie de l'Est, ne sont pas très grands, mais peut avoir des effets majeurs sur les écosystèmes d'eau douce comme les lacs et les rivières. Non coché, ils deviennent envahissants, et peut même obstruer les canalisations et endommager les infrastructures, similaires aux impacts observés pour d'autres espèces envahissantes comme les moules zébrées et quagga dans la région des Grands Lacs.

    " Corbicula fermement établi à Lake Tahoe en 2007, ", explique Sudeep Chandra, écologiste aquatique et co-auteur de l'étude de l'Université du Nevada. "Ils influencent la qualité de l'eau et réduisent la clarté remarquable de l'habitat côtier du lac Tahoe. En recyclant et en excrétant des nutriments, les palourdes envahissantes contribuent à la croissance des algues littorales. Il est donc essentiel de les détecter autour du lac pour comprendre où les palourdes vont dégrader la qualité de l'eau. »

    Les palourdes envahissantes se produisent même dans l'arrière-cour de Larson à Champaign, Illinois. "Ils sont très distinctifs et sont hyper-abondants dans le centre de l'Illinois, " Larson dit. " Si vous voyez beaucoup de petits coquillages blancs sur le lit du ruisseau, ce sont probablement Corbicula ." Larson poursuit la recherche eDNA de son laboratoire sur Corbicula dans ces ruisseaux du centre de l'Illinois. « Parce que nous savons maintenant que le test eDNA fonctionne bien, nous voulons l'appliquer à d'autres questions, " dit Larson. " Y a-t-il un meilleur moment de l'année pour utiliser l'ADNe pour détecter cet envahisseur ? Si nous ne pouvons pas trouver leur ADN en hiver, fait-il des pics en été ? Les inondations mobilisent-elles beaucoup d'ADN, le rendant facile à détecter ou les inondations diluent-elles l'ADN qui s'y trouve ?" Larson espère que les réponses à ces questions supplémentaires aideront les gestionnaires et les chercheurs à trouver et à réagir aux nouvelles Corbicula invasions ailleurs avant qu'elles ne deviennent problématiques.

    L'étude, "Développement et validation sur le terrain d'un test d'ADN environnemental (eDNA) pour les palourdes invasives du genre Corbicula " est en ligne sur le journal Gestion des invasions biologiques . L'article est rédigé par Dominique A. Cowart, chercheur postdoctoral à l'U of I, et co-écrit par Mark A. Renshaw, Cristal A. Gatnz, et David M. Lodge de l'Université de Notre Dame, Scott P. Egan de l'Université Rice, et John Umek et Sudeep Chandra de l'Université du Nevada Reno.


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