Avec Halloween fini, aujourd'hui est traditionnellement le jour où les décorations de Noël sortent, il est donc approprié qu'un animal emblématique associé à la fête fasse un bond dans l'esprit des fêtes en rejoignant la liste des espèces dont le génome est séquencé. Publié aujourd'hui dans la revue en libre accès GigaScience , est un article décrivant le séquençage et l'analyse du génome du renne. Ce travail, bien qu'il soit peu probable de révéler pourquoi le renne du Père Noël peut voler, fournit une grande ressource pour acquérir une meilleure compréhension des processus d'évolution, domestication, élevage, et l'adaptation aux environnements extrêmes.

Le renne ( Rangifer tarandus ) est la seule espèce entièrement domestiquée chez le cerf, ou Cervidé, famille. C'est aussi le seul cerf qui a une répartition mondiale :couvrant la forêt boréale, toundra, subarctique, régions arctiques et montagneuses du nord de l'Asie, Amérique du Nord et Europe. Contrairement à tous les autres cervidés, il n'y a pas que les cerfs mâles qui grandissent et perdent des bois, mais aussi les femelles. Du point de vue de l'élevage, Le lait de renne est beaucoup plus riche en protéines et contient moins de lactose que le lait de vache. Ce dernier aspect rend la disponibilité de ce lait intéressante étant donné le pourcentage élevé de personnes intolérantes au lactose dans le monde. Avec cette variété de caractéristiques uniques, la disponibilité d'une séquence du génome du renne peut fournir tout un traîneau plein de nouvelles informations, et est un nouveau membre bienvenu dans le club d'élite des espèces domestiquées avec des génomes de référence, y compris la vache, mouton et chèvre.

Ce travail a été réalisé par une équipe de chercheurs chinois de l'Académie chinoise des sciences agricoles de Changchun et de l'Université polytechnique du Nord-Ouest de Xi'an. Les chercheurs ont prélevé un échantillon de sang sur un enfant de deux ans, renne femelle d'un troupeau domestiqué entretenu par des chasseurs-éleveurs nomades Ewenki dans les montagnes du Grand Khingan en Chine. Ils ont séquencé, assemblé, annoté le génome et a montré qu'il était de haute qualité. Comparaison du génome du renne aux génomes d'espèces apparentées et à l'homme, a révélé que la taille du génome du renne (2,6 Go ou 2,6 milliards de paires de bases) est légèrement inférieure à celle de l'homme, vaches, et des chèvres, et à peu près la même taille que les moutons.

Le premier auteur de l'article, Zheping Li, professeur agrégé à l'Institut des sciences spéciales animales et végétales de l'Académie chinoise des sciences agricoles, a noté que l'analyse a également identifié « 335 gènes spécifiques au renne qui sont susceptibles d'aider à comprendre les caractéristiques biologiques particulières du renne. études entre rennes et autres ruminants."

Avec cet objectif en tête, les chercheurs ont également construit un arbre évolutif en utilisant le nouveau génome et les génomes déjà disponibles des membres de la famille bovine. Ils ont trouvé ce renne, bovins, et des chèvres séparées d'un ancêtre commun il y a environ 29,6 millions d'années. C'était à l'époque de l'Oligocène où l'un des changements majeurs a été l'expansion mondiale des prairies.

Cet article a été l'un des gagnants du premier GigaScience compétition et piste de prix qui est utilisée pour promouvoir de nouveaux, en pointe, recherche. Les auteurs ont présenté leurs travaux lors d'une session spéciale lors de la 12e conférence internationale annuelle de BGI sur la génomique à Shenzhen le vendredi 27 octobre. En tant que concours de science ouverte, cet article et les autres articles des gagnants ont été examinés de manière totalement ouverte, où le public pourrait suivre l'intégralité du processus de publication depuis la mise à disposition ouverte du projet d'article sur le serveur de pré-impression Biorxiv, le processus d'examen par les pairs effectué en direct avec des examens mis à disposition avant la décision de publication dans le système d'examen de superposition Academic Karma, suivi de décisions éditoriales, révisions de manuscrits et publication d'articles avec tous les éditeurs, auteur, et la correspondance des réviseurs mise à disposition avec l'article publié.