KFU Extreme Biology Lab et RIKEN ont découvert de nouveaux faits sur la croissance des embryons de poulet, ce qui peut conduire à des découvertes similaires sur les humains. L'ouvrage est publié dans PLOS Biologie .

Rouslan Devyatiyarov, associé de recherche junior au KFU Extreme Biology Lab, mentionné, « Les résultats obtenus sont actuellement présentés sous la forme d'une base de données organisée de promoteurs dans des embryons de poulet à différents stades de développement, et la recherche publiée est l'article source contenant l'annotation et la description des propriétés de base de ces promoteurs et de l'activité des gènes qui leur sont liés."

« La méthode CAGE est souvent utilisée dans le projet FANTOM pour déterminer le point de départ de la transcription des gènes. CAGE a déjà permis d'identifier des promoteurs de tissus et de cellules spécifiques de l'homme, souris, la drosophile et d'autres organismes modèles.

"Il est impossible de tester des embryons humains en raison de directives éthiques. C'est pourquoi le projet manquait de données sur le développement embryonnaire. Nous pensons que l'organisme le plus proche correspondant au rôle de remplacement est la poule domestique car il s'agit d'un organisme amniotique avec un développement relativement conservateur.

"Nous avons utilisé des échantillons biologiques depuis le moment de la ponte jusqu'au moment de l'éclosion, puis préparé des bibliothèques CAGE et les a séquencées. Ainsi, nous avons créé une annotation complète du génome des points d'initiation de la transcription à différents stades de l'embryogenèse du poulet. Par ailleurs, nous avons ajouté des données sur des tissus et des cellules spécifiques, à savoir, hépatocytes, cellules des muscles aortiques non striés, mésenchyme, pattes et ailes lors de leur émergence au troisième jour du développement embryonnaire. Nos données transcriptomiques peuvent être utilisées pour comparer l'évolution des promoteurs afin de déterminer les facteurs clés de transcription, gènes ou leurs isoformes qui contribuent à la formation des tissus."

FANTOM est principalement engagé dans la recherche sur les mammifères, et les poulets ne sont pas son objectif principal. Cependant, après cet essai réussi, les scientifiques ont décidé de poursuivre la recherche. L'intérêt principal de l'équipe, en raison de son accent sur les conditions extrêmes, se concentre sur la capacité des embryons de poulet à suspendre la croissance à des températures plus basses. Cette capacité d'hibernation n'a pas encore été étudiée à fond, et il promet des implications pratiques intéressantes.

"Quand une poule quitte son dortoir, les embryons cessent de se développer jusqu'à ce que la température atteigne la norme. C'est-à-dire, lorsque les œufs sont refroidis à 16 degrés, ils entrent en hibernation. Hibernation chez les poulets, bien sûr, n'est pas aussi extrême que l'anhydrobiose, mais ce processus peut être plus facile à adapter aux tissus et cellules humains. Ainsi, déterminer les composants moléculaires clés de la régulation de ce processus est notre prochaine étape", a ajouté M. Devyatiyarov.

La base de données est disponible en ligne à l'adresse http://fantom.gsc.riken.jp/zenbu/