Quand un bébé met quelque chose du sol dans sa bouche, on panique, mais la bouche contient déjà des milliers de bactéries. Maintenant, une équipe de chercheurs examine des vestiges archéologiques pour un exemple de la façon dont les biomes oraux japonais ont changé et ce qu'ils disent sur les personnes qui possédaient ces bouches et ces dents.

"Nous pouvons maintenant examiner ces communautés en séquençant l'ADN ancien conservé dans la plaque dentaire calcifiée ou le tartre dentaire, fournir des informations sur les origines des maladies et leurs liens avec l'histoire humaine, " les chercheurs ont rapporté dans une édition spéciale de Transactions philosophiques de la Royal Society B .

Laura S. Weyrich, professeur agrégé d'anthropologie, et son équipe a examiné des milliers de squelettes dans des collections et a choisi des spécimens qui avaient le plus gros tartre sur les dents. Calcul, parfois appelé tartre, se forme lorsque la plaque dentaire n'est pas éliminée par le brossage ou la soie dentaire. Il adhère fortement à la surface des dents et, à l'époque moderne, est éliminé lors du nettoyage des dents au cabinet du dentiste. Parce que la plaque dentaire est un biofilm composé principalement de bactéries, calcul d'échantillonnage, ancien ou moderne, peut fournir une identification ADN des microbes dans la bouche.

Les chercheurs se sont concentrés sur deux périodes. La population la plus âgée vivait 3, il y a 000 ans pendant la période Jomon et étaient des chasseurs-cueilleurs. La population plus jeune vivait il y a 400 à 150 ans pendant la période Edo et était des agriculteurs.

En utilisant ces deux populations, Weyrich et son équipe pourraient étudier comment le biome oral a changé au fil du temps et comment l'introduction de l'agriculture a affecté la composition des bactéries et des champignons. Ils ont également examiné l'association du biome avec les maladies bucco-dentaires telles que les maladies parodontales et les caries dentaires.

Les chercheurs n'ont pas trouvé de différence significative entre les premiers chasseurs-cueilleurs et les derniers agriculteurs, bien que "il semble que certains microbes aient pu être introduits au Japon avec l'introduction de la riziculture, " dit Weyrich.

Les chercheurs ont découvert une différence entre les biomes oraux trouvés chez les sujets masculins et féminins. Une possibilité pour cela était la pratique des femmes japonaises de noircir leurs dents. Cette pratique culturelle peut avoir migré d'autres pays asiatiques et, au Japon, était un symbole du mariage parmi la classe aristocratique. Cette pratique, appelé ohaguru, a été interdit au Japon en 1870.

Les composés utilisés pour noircir les dents, qui devait être appliqué systématiquement, peut avoir affecté le microbiome buccal des femmes. Ces composés contenaient souvent un minéral, comme le fer, mélangé avec un acide, comme le vinaigre, puis mélangé avec un colorant, comme le thé.

Les chercheurs ont noté que « de façon surprenante, la pratique de l'ohaguru était censée protéger les dents de la carie dentaire, cependant, nous le trouvons associé à des signes de maladie parodontale, soulevant des questions sur ses bienfaits pour la santé.

L'équipe a examiné à la fois la diversité alpha et bêta. Diversité alpha, dans ce cas, est la diversité des espèces au sein d'un hôte, et la diversité bêta est la différence de diversité entre différents hôtes.

"La diversité Alpha n'est pas différente entre les hommes et les femmes, " dit Weyrich. " Tout le monde a à peu près le même numéro. Il n'y avait pas non plus de différence significative dans la diversité bêta."

Alors que le nombre d'espèces de bactéries était le même, les chercheurs ont vu une différence entre les périodes Jomon et Edo.

"Ce qui devient différent, c'est de savoir si les souches sont les mêmes ou non, " a déclaré Weyrich. " De nouvelles souches de la même espèce sont introduites par l'agriculture et ce sont elles qui deviennent dominantes. Les souches du Jomon montrent des signes d'extinction."

Ces souches apparentées à l'agriculture apparaissent sur une branche différente de l'arbre évolutif pour les bactéries, indiquant qu'ils venaient d'ailleurs.

"Il s'agit de la première étude à examiner d'anciens microbiomes dans une population asiatique, " dit Weyrich.

Weyrich a noté qu'il existe de nombreux problèmes de contamination potentiels pour l'analyse de l'ADN. Les dents avaient été enfouies dans le sol, il y avait donc des microbes du sol. Les chercheurs étaient également préoccupés par la contamination par leur propre ADN microbien. Pour éviter cela, ils portaient des combinaisons intégrales, gants et masques.