Wegener a utilisé des preuves climatiques pour étayer son hypothèse de dérive des continents. Il a examiné la répartition de certaines plantes et animaux fossiles, en accordant une attention particulière aux espèces qui n'étaient pas capables de longues migrations ou de dispersion généralisée. En faisant correspondre la répartition de ces espèces sur différents continents, il a fait valoir qu'elles devaient autrefois faire partie d'une masse continentale plus vaste.

Un exemple utilisé par Wegener était la présence de Glossopteris, une fougère qui vivait à la fin du Carbonifère et au début du Permien. Des fossiles de Glossopteris ont été trouvés en Amérique du Sud, en Afrique, en Inde et en Australie. Wegener a proposé que ces continents faisaient autrefois partie d'une seule masse continentale, qu'il a appelée Gondwana, et que l'éclatement du Gondwana a conduit à la séparation de ces continents et à l'extinction de Glossopteris.