Des chercheurs de l'Université Monash ont validé un moyen de détecter avec succès un large éventail de bactéries (agents pathogènes) qui causent des maladies diarrhéiques dans les établissements informels.

Une meilleure protection contre les maladies pour les personnes vivant dans les communautés confrontées à l'eau, les défis de l'assainissement et de l'hygiène sont essentiels, car les microbes qui causent des maladies gastro-intestinales (entéropathogènes) sont responsables de 1,4 million de décès par an, principalement chez les enfants de moins de cinq ans, et causent des troubles de la nutrition et du développement.

Cependant, il est très difficile de surveiller efficacement leur propagation en raison du grand nombre d'agents pathogènes et de sources impliqués. De nombreux entéropathogènes provoquent des diarrhées et d'autres maladies gastro-intestinales, virus couvrant, bactéries, amibe, et des vers, chacun avec des caractéristiques distinctes. De plus, ils se propagent par des voies complexes via l'homme, animal, environnemental, et sources de nourriture. Traditionnellement, les microbiologistes ne surveillent que certains agents pathogènes et chaque source est généralement testée séparément.

L'étude, Publié dans La santé planétaire du Lancet , évalué pour la première fois la méthode de laboratoire appelée TaqMan Array Card (TAC) par rapport à la méthode de référence, réaction en chaîne par polymérase quantitative standard (qPCR). Ils ont constaté que le TAC est plus rapide et moins cher que la qPCR, tout en fournissant des résultats d'une précision comparable et en détectant simultanément plus de 30 entéropathogènes différents.

Le Dr Rachael Lappan, microbiologiste du Biomedicine Discovery Institute de l'Université Monash, a co-dirigé l'étude comparative à l'aide d'échantillons d'eaux usées de Melbourne et de selles humaines, excréments d'animaux, sol, et des échantillons d'eau provenant d'établissements informels à Suva, Fidji. Elle dit que la validation de la méthode TAC est un grand pas en avant dans la lutte contre le problème complexe et négligé de la diarrhée infantile.

« Les entéropathogènes peuvent être détectés de différentes manières dans les quartiers informels, et cela peut être un vrai défi de les surveiller car il y a une telle variété d'entéropathogènes qui contribuent à la maladie, ' explique le Dr Lappan. « TAC offre un moyen relativement simple et abordable de le faire, et cela peut être fait sur n'importe quel type d'échantillon.'

"C'est incroyablement important car cela nous aidera à mieux comprendre et surveiller les voies par lesquelles les gens tombent malades, et aider à cibler ces voies avec des interventions efficaces de gestion de l'eau qui pourraient finalement conduire à une meilleure santé, comme celui que nous testons dans le cadre du programme Revitaliser les quartiers informels et leurs environnements (RISE), ' a déclaré le Dr Lappan.

Co-auteur principal de l'article, Professeur agrégé Chris Greening du Biomedicine Discovery Institute de l'Université Monash, ajoute « en comparant ces méthodes, nous voulions savoir si la capacité de détecter efficacement une large gamme d'entéropathogènes entraînerait un inconvénient substantiel en termes de sensibilité. Cependant, nous avons montré que la TAC fonctionne de manière comparable à la qPCR et qu'elle est idéalement adaptée pour un large dépistage des agents pathogènes qu'il n'est pas pratique de réaliser via une qPCR standard.'

L'étude a été menée dans le cadre du programme Revitaliser les quartiers informels et leurs environnements (RISE), un programme de recherche interdisciplinaire et un essai visant à améliorer la gestion de l'eau et de l'assainissement dans les établissements urbains informels dotés d'infrastructures basées sur la nature. AUGMENTER, et autres eaux de transformation, programmes d'assainissement et d'hygiène, ont besoin de techniques qui permettent une surveillance complète mais efficace des entéropathogènes pour comprendre la contamination de l'environnement et la charge de morbidité avant et après les interventions.