Phytobiomes . Crédit :The American Phytopathological Socieity
Culture de couverture, ou la pratique de cultiver des cultures non récoltées pour protéger et enrichir le sol pendant les périodes de contre-saison, est une approche prometteuse pour réduire certains des impacts environnementaux négatifs de l'agriculture de production.
La culture de couverture a aussi ses risques, surtout si les cultures de couverture en train de mourir encouragent la pression de la maladie qui se transmet à la culture suivante. Telle est la leçon inattendue d'une étude récente publiée dans Phytobiomes , une nouvelle revue en libre accès de l'American Phytopathological Society.
Dans cet article récemment publié, intitulé "Isolement des Oomycètes résistants à la culture, Détecté pour la première fois en tant que séquences d'amplicons, à partir de racines de seigle d'hiver terminé par un herbicide, " Le Dr Matthew G. Bakker et plusieurs autres chercheurs du service de recherche agricole du département de l'Agriculture des États-Unis ont entrepris de décrire la microbiologie des racines des cultures de couverture de seigle mourantes et la façon dont leurs communautés microbiennes ont changé au fil du temps dans un champ. Ce qu'ils ont découvert de façon inattendue était le potentiel de risque élevé de maladie dans le maïs suite à l'utilisation de céréales de seigle comme culture de couverture.
Dans cette étude, Bakker et ses collègues ont prélevé des échantillons de racines dans un champ et les ont ramenés à leur laboratoire pour analyse ADN. Parmi les nombreux micro-organismes détectés, ils ont découvert que plusieurs espèces moins connues d'oomycètes, comprenant Pythium et Lagena espèce, étaient communément associées aux cultures de couverture de seigle céréalier. Ces micro-organismes sont souvent responsables de maladies des plantes.
Après avoir modifié les méthodes standard pour permettre la collecte de ces Pythium espèces en tant que cultures pures, les chercheurs ont continué à étudier leur activité dans les racines des cultures de couverture, y compris la période après la mort des cultures de couverture et la plantation du maïs pour la saison de croissance régulière.
Alors que cette recherche se voulait à l'origine fondamentale, l'étude s'est avérée contre toute attente avoir des résultats très pratiques. En plus de décrire et de valider la microbiologie de ces racines de couvert de seigle, leurs travaux ont révélé que le Pythium espèces transmises naturellement aux plants de maïs au fur et à mesure qu'ils ont poussé en semis, entraînant une maladie des semis.
"Cette étude raconte une belle histoire sur la façon dont les nouvelles techniques de recherche peuvent conduire à des résultats imprévisibles avec des applications importantes et pratiques, " a déclaré Bakker. " De manière inattendue, cela a mis en évidence la nécessité d'une gestion plus éclairée des cultures de couverture afin de minimiser le risque de maladie pour les cultures qui suivent, comme le maïs."
"Un autre aspect intéressant de cette étude était que les espèces les plus abondantes de Pythium dans la culture de couverture, les racines étaient différentes d'un côté du champ à l'autre. Du point de vue de la biologie et de l'écologie des agents pathogènes, c'est très intéressant. Ce changement est-il dû à la concurrence entre les deux ? Ou à cause des différences dans les exigences en matière d'habitat? Ou à cause de la capacité limitée de se déplacer sur le terrain ? »
Les autres avantages de cette étude comprennent...
Bakker espère que ce travail et des travaux similaires susciteront davantage de recherches sur la dynamique des sols et des racines.
"Il y a eu peu d'études à ce jour qui suivent en détail la dynamique de la communauté microbienne, en particulier dans les racines des plantes en train de mourir, " dit Bakker. " C'est surprenant, étant donné l'importance des racines des plantes pour l'environnement du sol et l'importance des résidus végétaux souterrains pour la formation de la matière organique du sol.
