Le Honduras est le deuxième plus grand pays d'Amérique centrale, s'étendant à travers l'isthme des Caraïbes au Pacifique. En dépit de la déforestation agressive, le Honduras maintient toujours plus de zones boisées que la plupart des autres pays de la région. Plusieurs types de forêts dominent le paysage, y compris la forêt de nuage, la forêt de pins, la forêt tropicale et les mangroves. Les espèces végétales et animales abondent dans les divers écosystèmes forestiers du Honduras, y compris les espèces qui ont disparu du reste de la région.

Mammifères

Plus de 200 espèces de mammifères se trouvent dans les forêts de Honduras. Les chauves-souris (chiroptères) représentent près de la moitié des mammifères du pays, avec 98 espèces connues occupant tous les écosystèmes forestiers. Le jaguar emblématique (Panthera onca) est l'une des espèces les plus rares de toute l'Amérique centrale. Le plus souvent vu dans les zones de mangrove, les jaguars sont une espèce en voie de disparition au Honduras. Les lamantins antillais (Trichechus manatus), autrefois communs le long de la côte caraïbe du Honduras, sont maintenant rarement observés, sauf dans les mangroves isolées. L'animal national du Honduras, le cerf de Virginie (Odocoileus virginianus), est la plus grande espèce de cerfs du pays. Le plus souvent vu dans les basses terres et les forêts de pins, le cerf de Virginie est une espèce protégée. On trouve également au Honduras une grande variété de singes, dont le capucin à tête blanche (Cebus capucinus), le singe araignée mexicain (Ateles geoffroyi vellerosus) et le singe hurleur à collier doré (Alouatta palliata palliata).

Oiseaux

Le Honduras a une diversité d'espèces d'oiseaux exceptionnellement riche. Il y a 18 espèces de perroquets, dont la perruche à nez orange (Brotogeris jugularis), le grand ara vert (Ara ambigua), la perruche du Pacifique (Aratinga strenua) et l'ara macao (Ara macao), oiseau national du Honduras. Trouvé dans les forêts tropicales de haute altitude, l'hirondelle à capuchon noir (Notiochelidon pileata) est un oiseau migrateur commun au Honduras. Le toucan mandarinier (Ramphastos swainsonii) est fréquent dans les forêts côtières des basses terres du Honduras. Connus pour leur visage aux couleurs vives et leur bec exagéré, ils sont parfois gardés comme animaux de compagnie bien qu'ils soient une espèce protégée.

Arbres

Chaque écosystème forestier a une espèce clé, ce qui signifie qu'une espèce définit la forêt type. Au Honduras, la mangrove noire (Avicennia germinans) et la mangrove rouge (Rhizopora mangle) indiquent les limites de l'écosystème de la mangrove. Les acajous (Swietenia macrophylla) sont parfois mêlés à des mangroves sur la terre ferme, ce qui indique le début des forêts côtières de pins des basses terres. Le pin du Honduras (Pinus caribaea var hondurensis) et le pin ocote (Pinus oocarpa) sont les deux seules espèces de pins du pays, bien qu'ils dominent de vastes étendues de forêts de plaine. L'un des arbres les plus impressionnants au Honduras est le Ceiba (Ceiba pentandra). Parfois appelé kapok, c'est un arbre massif qui peut atteindre 250 pieds de hauteur avec un tronc de 10 pieds de diamètre.

Plantes à fleurs

Les scientifiques estiment qu'il y a plus de 5000 espèces de plantes dans Honduras. Les plantes à fleurs abondent dans la plupart des régions du pays, où elles fournissent de la nourriture aux insectes et aux oiseaux. L'une des espèces végétales les plus prolifiques au Honduras est la sauge (Salvia). La sauge de pêche (Salvia dorisiana), la sauge de Karwinski (S. karwinskii) et la sauge de la vigne bleue (Salvia cacaliifolia) sont toutes des espèces arbustives et vivaces qui prospèrent dans les forêts montagneuses du centre du Honduras. Autrefois une source de nourriture pour les populations indigènes, le lotus jaune (Nelumbo lutea) est l'une des rares plantes à fleurs trouvées dans les forêts de mangrove. Connu pour ses fleurs jaunes en forme de coupe, il est souvent cultivé dans les jardins d'eau comme plante ornementale.