Les lagons ont généralement une ou plusieurs connexions restreintes avec l'océan, appelées criques. La limite d'une lagune est généralement définie par les terres qui l'entourent, y compris les îles ou les bancs de sable qui peuvent être présents à l'entrée. En outre, la limite peut également être définie par la profondeur de l’eau, car les lagons sont souvent des plans d’eau peu profonds. La limite d’un lagon peut également être définie par les types de plantes et d’animaux qui y vivent. Par exemple, certains lagons peuvent abriter des mangroves ou des herbiers marins, tandis que d’autres peuvent abriter des récifs coralliens.