Lorsque des fermes piscicoles sont construites le long de la côte, les déchets peuvent se retrouver dans les eaux environnantes. Cela peut inclure des aliments non consommés, des excréments et d’autres matières organiques. Cela peut polluer l’eau et nuire à l’environnement, notamment en endommageant les récifs coralliens et en tuant les poissons.

Pour réduire la pollution provenant des fermes piscicoles, un certain nombre de mesures peuvent être prises, notamment :

- Utiliser un système de confinement fermé, qui empêche les déchets de s'échapper dans l'environnement

- Utiliser des filtres et autres systèmes de traitement pour éliminer les déchets de l'eau

- Nettoyer régulièrement la pisciculture et éliminer les déchets

- Utiliser des aliments spécialement conçus pour être facilement digérés et produire moins de déchets