Le nombre de protons dans un atome définit son numéro atomique. Le carbone, par définition, a un nombre atomique de 6. Par conséquent, un atome neutre du carbone-13 aura 6 protons .

Le "13" dans ¹³c fait référence à la masse atomique, qui est le nombre total de protons et de neutrons dans le noyau. Cela nous dit que ¹³c a 7 neutrons, mais le nombre de protons reste constant pour tous les isotopes de carbone.