Voici une ventilation:

* Effet hydrophobe: Les molécules d'eau sont polaires et forment de fortes liaisons hydrogène entre elles. Les molécules non polaires (comme les chaînes latérales hydrophobes) perturbent ces liaisons hydrogène et sont donc défavorables dans un environnement aqueux. Pour minimiser cette perturbation, les chaînes latérales hydrophobes se regroupent à l'intérieur de la protéine, loin de l'eau.

* Stabilisation: Ce regroupement n'est pas entraîné par une attraction directe entre les chaînes latérales hydrophobes. Au lieu de cela, c'est une conséquence de l'entropie accrue (trouble) des molécules d'eau environnantes lorsque les groupes hydrophobes sont enterrés dans la protéine. Cette augmentation de l'entropie entraîne le processus de pliage et stabilise la structure des protéines pliées.

En résumé, les chaînes latérales hydrophobes d'une protéine sont poussées à se réunir dans un environnement aqueux pour minimiser la perturbation des molécules d'eau et augmenter l'entropie globale du système. Il s'agit d'une force motrice majeure dans le repliement des protéines.