Structure moléculaire du MOF fonctionnalisé rotaxane.(A ) Représentation d'un lieur organique reliant quatre Zn4 inorganiques O coins. L'image de gauche esquisse la structure du bloc de construction, l'image du centre montre une image atomistique du bloc de construction en représentation boule et bâton, et l'image de droite montre une simplification de l'image atomistique. Les coins inorganiques sont visualisés par de grosses boules jaunes et la barre transversale moléculaire (axe du rotaxane) est simplifiée par un bâton rouge. (B ) Visualisation de la structure des pores à partir du z direction (vue de dessus). L'image dans le coin supérieur gauche montre l'orientation du bloc de construction à partir du z direction. L'image sur le côté droit montre la structure des pores de la structure MOF assemblée périodiquement. Pour plus de clarté, différentes parties du MOF sont omises, mettant en évidence la disposition des barres transversales (extrait en haut à droite, simplifié par une représentation en bâton coloré), des lieurs organiques (extrait en bas à gauche) et des anneaux (extrait en bas à droite). La vue agrandie illustre l'arrangement relatif de trois lieurs dans un pore. (C ) Illustration de la disposition des traverses en z direction. L'image du haut montre une vue en perspective sur l'hélice moléculaire, formée par les barres transversales à l'intérieur d'un pore. L'image du bas montre la disposition en forme de chaîne le long du z direction. La fine connexion grise entre les barres transversales (bâtons de couleur) n'est qu'un guide pour l'œil soulignant la structure de la chaîne. (D ) Différenciation des arrangements d'anneaux en trois cas, chacun avec des environnements locaux différents. (E ) Fonction de distribution radiale (RDF) mesurant la distance relative entre les anneaux pour les trois cas (M , graphique violet ; D , graphique vert; T , graphique bleu foncé). La ligne rouge marque la distance à une chaîne unidimensionnelle adjacente. Crédit :Progrès scientifiques (2022). DOI :10.1126/sciadv.abn4426
Les physiciens de l'Université de Münster sont les premiers à révéler avec succès l'interaction dynamique d'une classe de machines moléculaires artificielles - les navettes moléculaires - en utilisant des simulations de dynamique moléculaire. L'étude a maintenant été publiée dans Science Advances .
Les machines moléculaires contrôlent un nombre important de processus fondamentaux dans la nature. Enchâssés dans un environnement cellulaire, ces processus jouent un rôle central dans le transport intracellulaire et intercellulaire des molécules, ainsi que dans la contraction musculaire chez l'homme et l'animal. Pour que l'ensemble de l'organisme fonctionne, une orientation et une disposition bien définies des machines moléculaires sont essentielles. Par exemple, l'intégration spécifique des protéines motrices - qui forment une classe de machines biomoléculaires - permet une interaction dynamique entre les innombrables protéines. En conséquence, le mouvement au niveau moléculaire est amplifié et transféré à travers diverses grandeurs jusqu'au niveau macroscopique.
Inspiré de ces systèmes biologiques, le développement de matériaux de type cellulaire à base de machines moléculaires artificielles est un domaine de recherche actuel. Afin d'utiliser la coopérativité moléculaire de ces machines dans des matériaux correspondants spécifiquement pour des applications en science des matériaux ou en médecine, une compréhension fine à la fois de l'encastrement moléculaire dans une matrice et des interactions intermoléculaires est décisive. Elena Kolodzeiski et le Dr Saeed Amirjalayer de l'Institut de physique de l'Université de Münster sont les premiers à révéler avec succès l'interaction dynamique d'une classe de machines moléculaires artificielles - les navettes moléculaires - en utilisant des simulations de dynamique moléculaire.
Les navettes moléculaires sont construites à partir de molécules en forme d'haltère et en forme d'anneau qui sont liées entre elles par des liaisons mécaniques. "Ce lien mécanique au niveau moléculaire conduit à ce que l'anneau puisse se déplacer dirigé d'un côté à l'autre le long de l'axe. Ce mouvement de pendule spécifique a déjà été utilisé pour développer des machines moléculaires", explique Amirjalayer, qui a dirigé l'étude et récemment a déménagé à l'Institut de théorie de l'état solide de l'Université de Münster.
Sur cette base, des chercheurs du monde entier travaillent sur une utilisation ciblée de ces machines moléculaires dans des matériaux fonctionnels. Les charpentes métallo-organiques, qui sont assemblées dans une approche modulaire par des unités de construction organiques et inorganiques, se révèlent être une matrice prometteuse pour enchâsser ces molécules mécaniquement liées dans des structures de type cellulaire. Bien qu'une série de ces systèmes aient été synthétisés au cours des dernières années, une compréhension fondamentale des processus dynamiques dans ces matériaux fait généralement défaut.
"Notre étude fournit un aperçu détaillé du fonctionnement et de l'interaction des machines embarquées", déclare l'auteur principal Elena Kolodzeiski. "Parallèlement, nous avons pu déduire des paramètres permettant de faire varier le type de mouvement des navettes moléculaires au sein des charpentes organométalliques."
Un contrôle ciblé de la dynamique offre des possibilités prometteuses pour influencer les propriétés de transport des molécules dans les membranes ou pour coordonner les processus catalytiques. Les chercheurs espèrent que leurs simulations de dynamique moléculaire formeront la base de nouveaux types de matériaux pour des applications catalytiques et médicales. L'efficacité de ces matériaux est démontrée par les diverses fonctionnalités des machines moléculaires dans les cellules biologiques. Des chercheurs créent un film photographique d'un interrupteur moléculaire