Chez les bactéries sensibles au glyphosate, l'enzyme EPSPS dans la voie shikimate est bloquée par le glyphosate et les acides aminés aromatiques essentiels ne sont pas produits. Les bactéries résistantes au glyphosate ne sont pas affectées par l'herbicide. Dans le microbiome intestinal humain, 54 % des espèces bactériennes sont potentiellement sensibles au glyphosate. Crédit :Université de Turku
Le glyphosate est l'herbicide à large spectre le plus couramment utilisé. Des chercheurs de l'Université de Turku en Finlande ont développé un nouvel outil bioinformatique pour prédire si un microbe, par exemple. une bactérie intestinale humaine, est sensible au glyphosate.
"Le glyphosate cible une enzyme appelée EPSPS dans la voie du shikimate. Cette enzyme est cruciale pour synthétiser trois acides aminés essentiels. Basé sur la structure de l'enzyme EPSPS, nous sommes en mesure de classer 80 à 90 % des espèces microbiennes en sensibles ou résistantes au glyphosate, " dit le docteur Pere Puigbò, développeur du nouvel outil de bioinformatique.
Sur la base des analyses à l'aide du nouvel outil bioinformatique, 54% des espèces bactériennes intestinales humaines sont potentiellement sensibles au glyphosate.
"Cette étude révolutionnaire fournit des outils pour d'autres études afin de déterminer l'impact réel du glyphosate sur le microbiote intestinal humain et animal et donc sur leur santé, " explique le docent Marjo Helander.
On pense que le glyphosate est sûr à utiliser car la voie du shikimate ne se trouve que dans les plantes, champignons et bactéries. Cependant, le glyphosate peut avoir un fort impact sur les espèces bactériennes du microbiome humain, et plusieurs études récentes ont montré que les perturbations du microbiome intestinal humain sont liées à de nombreuses maladies. Par conséquent, l'utilisation généralisée du glyphosate peut avoir un effet important sur les microbiomes intestinaux ainsi que sur la santé humaine.
La prédominance de cet herbicide sur le marché des pesticides est principalement attribuée à l'utilisation de cultures transgéniques, comme le soja, maïs et canola, qui sont souvent cultivées en tant que variétés résistantes au glyphosate en dehors de l'Europe. En Europe, le glyphosate est couramment utilisé pour dessécher les céréales, cultures de haricots et de semences avant la récolte. Il est également utilisé pour éradiquer les mauvaises herbes avant le semis dans les systèmes de culture sans labour.
Le risque de rencontrer des résidus de glyphosate dans les aliments cultivés en Finlande est faible, car la dessiccation des champs de céréales par le glyphosate n'est pas autorisée en Finlande.
Une communauté microbienne riche et diversifiée vit dans le sol, sur les surfaces végétales, et dans les entrailles des animaux. Il est possible que même de faibles résidus de glyphosate affectent indirectement la présence de ravageurs et d'agents pathogènes dans ces communautés.
« En plus de la bioinformatique, nous avons besoin de recherches expérimentales pour étudier les effets du glyphosate sur les communautés microbiennes dans des environnements variables, " ajoute Helander.