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De nouveaux développements dans les peptides antimicrobiens (AMP) dotés de propriétés antibiofilm se matérialisent rapidement. L'ABP agit en inhibant les bactéries résistantes aux antibiotiques dans le biofilm grâce à des molécules de signalisation nucléotidiques.
Les peptides antimicrobiens et le peptide antibiofilm (ABP) sont de nouvelles molécules antibiotiques dérivées de micro-organismes pour le traitement des infections. Les auteurs ont discuté de la signification, limitations et essais de ces peptides antimicrobiens issus de bactéries, champignons, protozoaires et levures.
Ces peptides antimicrobiens sont petits, des séquences polypeptidiques cationiques et amphipathiques avec une large gamme de bactéries Gram-positives et Gram-négatives, virus et champignons de 6 à 100 acides aminés. Ces sources sont examinées en détail montrant la caractérisation de ces peptides antimicrobiens et leurs classes respectives.
La base de données APD3 a montré 333 bactériocines et antibiotiques peptidiques de bactéries, 4 fromarchaea, 8 de protistes, 13 provenant de champignons sont signalés. Les AMP bactériens sont caractérisés en fonction de leur nombre d'acides aminés et sont si petits avec une masse de 1 à 5 kDa que les AMP de classe II sont plus longs avec un nombre d'acides aminés d'environ 25 à 50.
Les bactériocines de classe II sont composées d'acides aminés homogènes et classées en différents groupes en fonction de leur structure secondaire. La lactococcine de classe II produite par Lactococcus lactis est la lactococcine B. Cette AMP est impliquée dans les modifications du potentiel membranaire.
Les composés AMP fongiques rapportés sont plus que l'AMP bactérien et se sont avérés être une bonne source de découverte de composés antimicrobiens contre les infections en raison de la similitude des caractéristiques et des réponses aux infections.
La méthode de balayage d'ADNc in silico est largement utilisée pour déterminer le séquençage de peptides de type défensine et plus de 100 AMP sont révélés à l'aide d'approches de criblage du génome.
Les peptaibols de l'AMP fongique isolés en tant que métabolites secondaires possèdent des activités antimicrobiennes et antifongiques. Ils ont de courtes chaînes d'acides aminés.