Carte 3D des molécules sur un guichet automatique. Cette carte montre comment nous transférons des molécules de notre peau aux objets avec lesquels nous interagissons, fournissant des informations qui peuvent avoir de nombreuses applications médico-légales. Crédit :UC San Diego et EMBL
Tous les jours, chaque centimètre de peau de votre corps entre en contact avec des milliers de molécules provenant de la nourriture, produits de beauté, transpiration, les microbes qui habitent votre peau. Désormais, les chercheurs peuvent créer des cartes 3D interactives qui montrent où chaque molécule s'attarde sur votre corps, grâce à une nouvelle méthode développée par les chercheurs de l'Université de Californie à San Diego et du Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL). La technique est publiée le 21 décembre dans Protocoles naturels .
Le but de cette cartographie 3D est de mieux comprendre comment les molécules de notre environnement, ainsi que celles produites par notre corps et les communautés microbiennes présentes sur notre peau, influencent les uns les autres et notre santé. Lorsque l'équipe a précédemment utilisé cette approche pour cartographier les molécules sur la peau de deux volontaires, ils ont trouvé des traces répandues de crème solaire et d'autres produits d'hygiène, même trois jours après leur dernière utilisation.
La méthode de cartographie moléculaire 3D est une idée originale de Pieter Dorrestein, Doctorat, professeur à la faculté de médecine de l'UC San Diego et à la faculté de pharmacie et des sciences pharmaceutiques de Skaggs, Théodore Alexandrov, Doctorat, chef d'équipe à l'EMBL en Allemagne, et leurs équipes. Ils ont déterminé la meilleure façon de prélever les échantillons, déterminer leur composition chimique par spectrométrie de masse, et construire le logiciel de cartographie utilisé pour l'analyse.
Après avoir été approchés par de nombreux collègues de domaines aussi divers que la médecine légale, produits de beauté, écologie et agriculture, les chercheurs ont converti la méthode de cartographie moléculaire 3D en une recette étape par étape avec un logiciel intuitif et l'ont mise à la disposition de la communauté scientifique mondiale.
Carte 3D des molécules sur une source de romarin. Les vieilles feuilles au bas de la plante de romarin ont des niveaux beaucoup plus élevés de cirsimarétine flavonoïde que les nouvelles feuilles au sommet. En utilisant des cartes comme celle-ci, les scientifiques peuvent étudier comment les plantes transportent les molécules des vieilles feuilles vers les jeunes, ou comment ils réagissent au stress. Crédit :UC San Diego et EMBL