Nanoéchelle (Numéro 42, 2017). Crédit :KAIST
Une équipe de recherche KAIST du professeur Hyun Gyu Park du département de génie chimique et biomoléculaire a développé une nouvelle technologie pour détecter l'activité de la RNase H, une enzyme de dégradation de l'ARN. L'équipe a utilisé une réaction d'amplification de signal hautement efficace appelée assemblage en épingle à cheveux catalytique (CHA) pour analyser efficacement l'activité de la RNase H. Considérant que la RNase H est nécessaire à la prolifération des rétrovirus tels que le VIH, ce résultat de recherche pourrait contribuer aux traitements du sida à l'avenir, disent les chercheurs.
Cette étude dirigée par Ph.D. les candidats Chang Yeol Lee et Hyowon Jang ont été choisis comme couverture pour Nanoéchelle (Numéro 42, 2017) publié le 14 novembre.
Les techniques existantes pour détecter la RNase H nécessitent un fluorophore et un extincteur coûteux, et impliquent une mise en œuvre complexe. Plus loin, il n'y a aucun moyen d'amplifier le signal, conduisant à une faible efficacité de détection dans l'ensemble. L'équipe a utilisé la technologie CHA pour surmonter ces limitations. CHA amplifie le signal de détection pour permettre un dosage plus sensible de l'activité RNase H.
L'équipe a conçu le système de réaction de sorte que le produit de la réaction CHA ait des structures G-quadruplexes, qui est approprié pour générer de la fluorescence. En utilisant des molécules fluorescentes qui se lient aux G-quadruplexes pour générer une forte fluorescence, l'équipe pourrait développer une méthode de détection de la RNase H haute performance qui surmonte les limites des techniques existantes. Plus loin, cette technologie pourrait cribler des inhibiteurs de l'activité de la RNase H.
L'équipe s'attend à ce que les résultats de la recherche puissent contribuer au traitement du SIDA. Le SIDA est une maladie causée par le VIH, un rétrovirus qui utilise la transcription inverse, au cours de laquelle l'ARN est converti en ADN. La RNase H est essentielle pour la transcription inverse du VIH, et ainsi l'inhibition de la RNase H pourrait à son tour inhiber la transcription de l'ADN du VIH.
Le professeur Park a dit, "Cette technologie est applicable pour détecter diverses activités enzymatiques, ainsi que l'activité de la RNase H. "J'espère que cette technologie pourra être largement utilisée dans la recherche sur les maladies liées aux enzymes."