Procaryotes manquent de noyau lié à la membrane. Leur ADN est situé dans une région appelée nucléoïde, qui n’est pas entourée de membrane. Ils manquent également d’autres organites liés à la membrane.
Eucaryotes , en revanche, possèdent un véritable noyau, qui contient leur matériel génétique (ADN) enfermé dans une membrane. Ils possèdent également d'autres organites liés à la membrane, tels que les mitochondries, l'appareil de Golgi, le réticulum endoplasmique, etc.
Voici un tableau résumant les principales différences :
| Fonctionnalité | Procaryotes | Eucaryotes |
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| Noyau | Absent | Présent |
| Organites | Absent (sauf ribosomes)| Présent |
| Taille des cellules | Généralement plus petit | Généralement plus grand |
| Structure de l'ADN | Circulaire | Linéaire |
| Exemples | Bactéries, archées | Animaux, plantes, champignons |