1. Recrutement des facteurs de transcription:

* Mécanisme: Les protéines liées à l'activateur peuvent interagir directement avec et recruter d'autres facteurs de transcription (TF) à la région promotrice du gène. Ces TF se lient souvent à des séquences d'ADN spécifiques au sein du promoteur, initiant l'assemblage du complexe de pré-initiation de transcription (PIC).

* Exemple: La protéine CREB (protéine de liaison de l'élément de réponse de l'AMPc) peut se lier à un élément de réponse à l'AMPc (CRE) au sein d'un amplificateur. Lorsqu'elle est activée par des voies de signalisation, CREB recrute d'autres TF comme CBP (protéine de liaison CREB) au promoteur, conduisant à une transcription accrue.

2. Remodelage de la chromatine:

* Mécanisme: Les protéines liées à l'activateur peuvent recruter des enzymes qui modifient la structure de la chromatine, ce qui rend l'ADN plus accessible à la machinerie transcriptionnelle. Cela peut impliquer:

* Acétylation des histones: L'ajout de groupes d'acétyle aux queues d'histones, desserrant l'emprise des histones sur l'ADN et la promotion de la transcription.

* méthylation des histones: L'ajout de groupes méthyle aux queues d'histones, qui peuvent soit activer ou réprimer la transcription en fonction du résidu de lysine spécifique modifié.

* Exemple: La protéine SWI / SNF est un complexe de remodelage de la chromatine qui peut être recruté pour les amplificateurs par des TF spécifiques. SWI / SNF remodèle ensuite les nucléosomes dans la région du promoteur, permettant à d'autres TF et à l'ARN polymérase d'accéder à l'ADN et à initier la transcription.

3. Boucle et proximité:

* Mécanisme: Les amplificateurs peuvent être situés loin des gènes qu'ils régulent, mais les protéines liées aux amplificateurs peuvent interagir avec des protéines liées à la région du promoteur, formant une boucle dans l'ADN. Cela amène l'activateur à proximité du promoteur, facilitant le recrutement de TF et l'initiation de la transcription.

* Exemple: La cohésine et le CTCF sont des protéines qui jouent un rôle dans la formation de boucles d'ADN. Le CTCF se lie à des séquences d'ADN spécifiques, tandis que la cohésine agit comme un pont pour relier ces séquences, créant des boucles et rapprochant les amplificateurs de leurs gènes cibles.

Il est important de noter que ces mécanismes fonctionnent souvent de concert, et la régulation spécifique d'un gène particulier peut impliquer une interaction complexe de multiples protéines et voies.