1. Séquence de reconnaissance:
* spécificité: Chaque enzyme de restriction reconnaît une courte séquence spécifique de nucléotides d'ADN. Cette séquence est généralement de 4 à 8 paires de bases et est appelée séquence de reconnaissance ou site de restriction .
* Nature palindromique: De nombreuses séquences de reconnaissance sont palindromiques, ce qui signifie qu'elles lisent les mêmes en arrière et en avant sur les brins d'ADN opposés. Par exemple, l'enzyme ECORI reconnaît la séquence GAATTC, qui est la même si vous la lisez de droite à gauche sur le brin complémentaire (CTTAAG).
2. Clivage:
* Coupe: Une fois que l'enzyme de restriction trouve sa séquence de reconnaissance, elle coupe la molécule d'ADN à un point spécifique de cette séquence.
* extrémités collantes par rapport aux extrémités émoussées: La façon dont une enzyme de restriction coupe peut produire des «extrémités collantes» ou des «extrémités émoussées».
* extrémités collantes: L'enzyme coupe les brins d'ADN à différentes positions, laissant de courts surplombs simples qui peuvent paire de bases avec des surplombs complémentaires d'autres molécules d'ADN coupées avec la même enzyme. Ceci est utile pour créer des molécules d'ADN recombinantes.
* Blunt se termine: L'enzyme coupe les deux brins d'ADN à la même position, ne laissant aucun surplomb.
en résumé:
Les facteurs suivants déterminent comment une enzyme de restriction coupera l'ADN:
* La séquence de reconnaissance spécifique de l'enzyme.
* l'emplacement de cette séquence dans la molécule d'ADN.
* Le motif de clivage spécifique de l'enzyme (extrémités collantes par rapport aux extrémités émoussées).
Exemple:
L'enzyme Ecori coupe l'ADN à la séquence GAATTC, produisant des extrémités collantes. Cela signifie qu'il coupera toute molécule d'ADN contenant cette séquence, et les fragments d'ADN résultants auront des surplombs simples qui peuvent être utilisés pour le clonage ou d'autres manipulations génétiques.
