Il a développé un système de classification des organismes en fonction de leurs caractéristiques partagées, connues sous le nom de taxonomie linnaeen . Ce système utilise une classification hiérarchique, avec des organismes regroupés en catégories de plus en plus spécifiques:
* royaume
* phylum
* classe
* Ordre
* famille
* genre
* espèces
L'œuvre de Linnaeus, publiée dans son livre Systema Naturae En 1735, jette les bases du système moderne de classification biologique et est toujours utilisé comme base pour comprendre les relations entre les êtres vivants.