Bien que ce ne soit pas le premier à proposer cette idée, la célèbre expérience de ballon à col de cygne de Pasteur dans les années 1860 a fourni des preuves solides contre la théorie dominante de la génération spontanée et a définitivement démontré que les bactéries proviennent de bactéries existantes, et non de matière non vivante.
Son travail a été crucial pour établir la Théorie des germes de la maladie et révolutionner notre compréhension de la microbiologie.