Voici pourquoi:

* Relations évolutives: Les protéines sont codées par des gènes et les gènes sont transmis des parents à la progéniture. Si deux espèces partagent une protéine très similaire, cela signifie que leurs gènes pour cette protéine sont également très similaires. Cela suggère fortement que ces espèces ont hérité du gène d'un ancêtre commun.

* Homologie moléculaire: Les similitudes de la structure et de la fonction des protéines sont appelées homologie moléculaire. Il s'agit d'un outil puissant pour comprendre les relations évolutives car elle fournit un lien tangible entre les organismes au niveau moléculaire.

* Mutations et temps: Au fil du temps, les mutations s'accumulent dans les gènes. Si deux espèces ont divergé d'un ancêtre commun il y a longtemps, leurs versions de la protéine auront accumulé plus de différences en raison de mutations indépendantes. S'ils ont divergé récemment, leurs protéines seront plus similaires.

Exemple: L'hémoglobine protéique, qui transporte de l'oxygène dans le sang, est très similaire chez l'homme et les chimpanzés. C'est une preuve solide que les humains et les chimpanzés partagent un ancêtre commun récent.