1. Enzymes:
* nucléases: Ces enzymes décomposent l'ADN. Il existe deux types principaux:
* dnases: Dégrader spécifiquement l'ADN.
* rnases: Dégrader l'ARN, mais peut également cliver l'ADN dans certaines conditions.
* Proteases: Ces enzymes décomposent les protéines, qui peuvent se lier à l'ADN et le rendre difficile à isoler.
2. Polymères:
* polysaccharides: Ces glucides peuvent former des gels collants qui piègent l'ADN. Les exemples incluent le glycogène dans les cellules animales et l'amidon dans les cellules végétales.
* protéines: Comme mentionné, les protéines peuvent se lier à l'ADN et entraver son extraction.
* Lipides: Les graisses et les huiles peuvent interférer avec les précipitations de l'ADN et rendre difficile le retrait de la solution.
3. Autres composants cellulaires:
* cellulose et lignine: Ce sont des composants structurels des parois des cellules végétales et peuvent être difficiles à éliminer, ce qui entrave l'isolement de l'ADN.
* Métabolites secondaires: Ces composés peuvent être produits par des plantes et des animaux et interférer avec l'extraction d'ADN. Les exemples incluent les tanins, les alcaloïdes et les pigments.
* Salts: Des concentrations élevées de sels peuvent perturber les précipitations de l'ADN et entraver sa purification.
4. Contamination:
* ADN microbien: L'ADN des bactéries, des champignons ou d'autres micro-organismes peut contaminer des échantillons.
* ADN environnemental: L'ADN provenant de sources comme le sol, l'eau ou l'air peut également contaminer des échantillons.
Pour relever ces défis, les protocoles d'extraction d'ADN incluent souvent des étapes qui:
* cellules Lyse: Pour ouvrir la membrane cellulaire et libérer l'ADN.
* Inactiver les enzymes: Par traitement thermique, inhibiteurs chimiques ou perturbation mécanique.
* Retirez les substances interférentes: Par la filtration, les précipitations ou d'autres méthodes.
* purifiez l'ADN: Utilisation de techniques telles que les précipitations d'éthanol ou la chromatographie sur colonne.
Il est important de considérer le type spécifique de cellule et l'application prévue lors du choix d'une méthode d'extraction d'ADN appropriée.
