* Organismes vivants: C'est ce qu'on appelle biotrophique alimentation. Certains champignons vivent dans une relation symbiotique avec les plantes (mycorhizae), les aidant à absorber les nutriments en échange de sucres. D'autres sont parasites et nuisent à leur hôte, comme les champignons provoquant le pied de l'athlète.
* Organismes morts: C'est ce qu'on appelle saprotrophique alimentation. Les champignons sont des décomposeurs essentiels, décomposant les plantes mortes et les animaux, relâchant les nutriments dans l'environnement.
Ainsi, les champignons peuvent être les deux parasites et décomposeurs , selon leurs besoins spécifiques et l'organisme avec lequel ils interagissent.