Il l'a fait en 1665 tout en regardant une fine tranche de liège au microscope. Il a observé de minuscules compartiments qui lui rappelaient les cellules dans un monastère, et il les a donc nommés "cellules".
Cependant, il est important de noter que Hooke n'a vu que les parois cellulaires des cellules végétales mortes. La première personne à voir une cellule vivante était Anton van Leeuwenhoek , qui a utilisé un microscope à objectif unique pour observer divers micro-organismes dans l'eau de l'étang et d'autres échantillons.