Voici une ventilation de la relation entre la concentration d'agarose et les propriétés du gel:
Haute concentration d'agarose (par exemple, 2%):
* petits pores: Une concentration d'agarose plus élevée crée un gel plus serré avec des pores plus petits. Ceci est idéal pour séparer les plus petits fragments d'ADN (moins de 1000 pb) car des molécules plus petites peuvent naviguer plus facilement dans les espaces restreints.
* Résolution supérieure: Des fragments plus petits migreront plus distinctement en raison de la taille des pores plus petite, ce qui entraînera des bandes plus nettes.
* Migration plus lente: Les molécules doivent se faufiler dans des espaces plus serrés, conduisant à des taux de migration plus lents.
Faible concentration d'agarose (par exemple, 0,5%):
* gros pores: Une concentration d'agarose plus faible crée un gel plus lâche avec des pores plus gros. Ceci est idéal pour séparer les fragments d'ADN plus grands (plus de 10 000 pb) car des molécules plus grandes peuvent passer plus facilement à travers les pores.
* Résolution inférieure: Des fragments plus grands peuvent ne pas être aussi bien séparés en raison de la plus grande taille de pores, conduisant à des bandes moins distinctes.
* Migration plus rapide: Des molécules plus grandes se déplacent dans le gel plus rapidement en raison de moins de résistance.
Choisir la bonne concentration:
La concentration d'agarose idéale dépend de la taille des molécules que vous souhaitez séparer:
* petits fragments d'ADN: Utilisez une concentration d'agarose plus élevée (1,5% -2%).
* Grands fragments d'ADN: Utilisez une concentration d'agarose plus faible (0,5% -1%).
* Objectif général: Une concentration standard de 1% est souvent utilisée pour une large gamme de fragments d'ADN.
Autres facteurs à considérer:
* Type d'agarose: Différents types d'agarose peuvent affecter la taille et la résolution des pores.
* tampon: Le tampon utilisé dans l'électrophorèse influence également les taux de migration et la résolution.
* champ électrique: La tension appliquée à travers le gel peut également avoir un impact sur les taux de migration.
En résumé, la concentration d'agarose dans l'électrophorèse sur gel est cruciale pour atteindre une résolution optimale et une séparation des fragments d'ADN. En sélectionnant soigneusement la concentration d'agarose appropriée, vous pouvez assurer une séparation efficace des molécules souhaitées.
