Cependant, il est important de noter que la classification des organismes en royaumes évolue constamment. Les systèmes de classification modernes placent souvent les procaryotes en deux domaines distincts:

* bactéries: Ce sont de vraies bactéries, un groupe diversifié d'organismes unicellulaires.

* Archaea: Ce sont des organismes unicellulaires qui se trouvent souvent dans des environnements extrêmes et ont des propriétés biochimiques uniques.

Bien que le Royaume de Monera soit une classification traditionnelle, le système de domaine est plus largement accepté aujourd'hui.