Le diaphragme d'un microscope est généralement situé sous la platine, où il contrôle la quantité de lumière qui traverse l'échantillon et monte dans le tube du microscope jusqu'aux oculaires ou à la caméra. Il est utilisé pour régler la luminosité et le contraste de l’image vue au microscope.

Certains microscopes peuvent avoir plusieurs diaphragmes, comme un diaphragme de champ et un diaphragme à iris. Ces diaphragmes peuvent être ajustés pour contrôler la taille et la forme du faisceau lumineux ainsi que la quantité de lumière qui le traverse, permettant ainsi un contrôle plus précis de la qualité de l'image et de la visibilité des caractéristiques de l'échantillon.