La principale différence entre l'ARNt et l'ARNm est la présence d'un anticodon dans l'ARNt. L'anticodon est une séquence de trois nucléotides sur l'ARNt, complémentaire d'un codon spécifique, qui est une séquence de trois nucléotides sur l'ARNm. L'anticodon de l'ARNt est responsable de la reconnaissance et de la liaison au codon complémentaire de l'ARNm lors de la synthèse des protéines. L'ARNt apporte le bon acide aminé au complexe d'ARNm en reconnaissant les trois nucléotides et en attachant l'acide aminé correspondant à la position correcte dans la protéine.