Le protoplasme à l’intérieur du noyau est appelé nucléoplasme ou caryoplasme. Il s’agit d’une substance épaisse semblable à un gel qui contient toutes les informations génétiques de la cellule, notamment les chromosomes, l’ADN et l’ARN. Le nucléoplasme contient également d'autres structures importantes telles que le nucléole, l'enveloppe nucléaire et les pores nucléaires.