2. Cycle de Krebs (cycle de l'acide citrique) : Cela se produit dans la matrice des mitochondries et implique une série de neuf réactions chimiques. Au cours du cycle de Krebs, les molécules de pyruvate issues de la glycolyse sont ensuite décomposées en dioxyde de carbone et en ATP. Ce processus aboutit également à la génération de NADH, FADH2 et GTP.
3. Phosphorylation oxydative : Cela se produit dans la membrane interne des mitochondries et implique une série de quatre complexes. Lors de la phosphorylation oxydative, les molécules NADH et FADH2 issues de la glycolyse et du cycle de Krebs sont utilisées pour générer de l'ATP. Ce processus aboutit également à la production d’eau.