Le flux génétique entre les espèces est l’un des principaux mécanismes pouvant piloter l’évolution des pinsons de Darwin. Lorsque deux espèces capables de se croiser entrent en contact, elles peuvent échanger des gènes, ce qui peut conduire à l'introduction de nouvelles adaptations ou à la perte de celles existantes.

Dans le cas des pinsons de Darwin, le flux génétique a joué un rôle important dans l'évolution de leur bec distinctif. Les différentes espèces de pinsons de Darwin ont un bec adapté à différentes sources de nourriture, comme les graines, les insectes ou le nectar. Lorsque deux espèces avec des formes de bec différentes entrent en contact, elles peuvent se croiser et produire une progéniture avec des formes de bec intermédiaires. Cela peut conduire à l’évolution de nouvelles formes de bec, mieux adaptées aux sources alimentaires spécifiques disponibles dans l’environnement.

Le flux génétique peut également conduire à l’extinction d’espèces. Si deux espèces en compétition pour les mêmes ressources entrent en contact, les espèces les moins performantes peuvent être supplantées et éventuellement disparaître. Cela peut se produire même si les deux espèces ne sont pas étroitement liées.

Dans l’ensemble, le flux génétique est une force puissante qui peut façonner l’évolution des espèces. Dans le cas des pinsons de Darwin, le flux génétique a joué un rôle important dans l'évolution de leur bec distinctif et a contribué à la diversification des espèces sur les îles Galapagos.