L'appel à la communauté scientifique, publié dans la revue Nature , est basé sur l'expérience acquise lors de la coordination du référentiel de métadonnées du réseau AviSample, qui contient actuellement les métadonnées de plus de 35 000 échantillons de près de 500 espèces d'oiseaux.

La communauté scientifique optimise systématiquement les activités de recherche et un certain nombre d’initiatives poursuivent activement cet objectif. Le projet dirigé par Brlík pousse ces efforts encore plus loin :« Notre initiative démontre que la disponibilité et la traçabilité des informations de base sur les échantillons (appelées métadonnées) ont le potentiel de rendre la recherche scientifique plus efficace, d'économiser des ressources financières et humaines et de diversifier les équipes de recherche. au niveau mondial."

Il ajoute :« Cette initiative ne concerne pas le stockage des échantillons physiques ou des données. Nous nous intéressons uniquement aux informations de base sur les échantillons biologiques, en termes simples, quand, où et comment les échantillons ont été collectés et comment ils sont conservés. ces métadonnées sont peu coûteuses, applicables à l'échelle mondiale et facilitent l'utilisation d'échantillons déjà collectés, ce qui profite à la fois aux propriétaires d'échantillons et aux chercheurs qui les utiliseront."

Le principe du partage des métadonnées des échantillons et de la réutilisation des échantillons existants est bénéfique à bien des égards. Les rapports centralisés et standardisés sur les métadonnées des échantillons permettent de voir facilement quels échantillons sont actuellement disponibles sans nécessiter de communication avec des collègues ni de collecte coûteuse de nouveaux échantillons.

Le partage de métadonnées pourrait donc rationaliser les activités scientifiques, notamment dans les zones moins explorées et difficiles d’accès, tout en renforçant les collaborations clés avec les scientifiques locaux. De même, la communication de métadonnées d'échantillons aiderait les scientifiques dont les recherches se concentrent sur les espèces menacées ou à grande échelle spatiale.

"L'idée initiale de cette initiative a été conçue pendant mes études de doctorat, alors que je cherchais des échantillons de plumes provenant d'une vaste zone d'Afrique subsaharienne. J'avais des échantillons de notre groupe de recherche, mais j'avais besoin d'élargir l'ensemble de données. considérablement.

"Nous avons écrit à des collègues en Suède et en Suisse qui, selon nous, détenaient des échantillons similaires provenant d'autres régions d'Afrique. Et heureusement, il s'est avéré qu'ils en possédaient bel et bien. Bien qu'ils aient principalement collecté les échantillons dans un but complètement différent, nous avons réussi à couvrir une grande partie de la région de l'Afrique subsaharienne grâce à cet effort commun, qui n'aurait pas été possible sans une coopération avec des collègues", explique Brlík, décrivant les origines du projet actuel.

En 2022, Brlík et une équipe de collègues (notamment Pavel Pipek du Département d'écologie, Faculté des sciences, Université Charles et Petr Procházka de l'Institut de biologie des vertébrés du CAS) ont créé le référentiel de métadonnées du réseau AviSample. Dans cette base de données, les ornithologues peuvent désormais saisir des métadonnées sur les échantillons d'oiseaux, c'est-à-dire où, quand et comment l'échantillon a été collecté, auprès de quelles espèces d'oiseaux et comment ces échantillons sont stockés.

La base de données comprend actuellement des informations sur près de 500 espèces d'oiseaux et des métadonnées pour plus de 35 000 échantillons sont disponibles. Le référentiel compte un certain nombre d'ambassadeurs qui participent à la diffusion de l'initiative dans leurs régions.

"L'un des exemples de réutilisation d'échantillons existants grâce au partage de métadonnées est le projet B10K. Ce projet vise à étudier le génome des 10 000 espèces d'oiseaux, que les coordinateurs du projet collectent principalement dans les musées.

"Cependant, pour les espèces rares et les espèces présentes dans des zones peu étudiées (par exemple les tropiques), il n'est pas facile d'obtenir des échantillons. Le partage de métadonnées d'échantillons stockés dans les collections des chercheurs a permis d'utiliser des échantillons existants collectés en Afrique et en Europe, pour cette vaste étude. projet à grande échelle", décrit Brlík.

Dans une correspondance publiée dans son article, Brlík montre, en utilisant le réseau AviSample comme exemple, que le partage de métadonnées facilite la réutilisation d'échantillons existants stockés dans les collections des chercheurs et présente donc un énorme potentiel.

"Mon objectif est de porter cette initiative et ce changement de perception à un niveau mondial et de montrer que le partage de métadonnées d'échantillons a le potentiel de faire progresser l'efficacité des activités scientifiques dans toutes les disciplines biologiques", conclut Brlík.