Les organigrammes bactériens fournissent une aide visuelle pour l'identification rapide des espèces bactériennes. Pour créer un organigramme, identifiez d'abord les caractéristiques communes des différents groupes de bactéries afin d'exclure les groupes non pertinents et de déterminer plus efficacement les bactéries présentes. Une variété de logiciels ont les éléments géométriques nécessaires pour traiter un groupe à la fois, par la coloration de Gram et la forme. Une espèce commune de bactéries de la peau, Staphylococcus aureus, offre un excellent point de départ, chaque étape de l'organigramme étant représentée par un rectangle, un ovale, un carré ou une boîte avec des lignes reliant chaque étape suivante pour les diagrammes et horizontalement pour les tableaux orientés paysage.
Précisez que la culture à tester est une culture pure. Identifiez également l'origine de l'échantillon pour réduire la portée de l'organigramme.
Ecrivez ou tapez "Gram Stain" comme test principal et créez deux ramifications à partir de cette boîte. Marquez les rejets "Gram positif" et "Gram négatif". Les taches à Gram positif, telles que Staphylococcus, apparaissent pourpres et les taches à Gram négatif, telles que E. coli, apparaissent en rouge. Les bactéries sont réparties dans ces deux groupes et la coloration de Gram est le premier test effectué sur un échantillon inconnu, car c'est une procédure simple et peu coûteuse qui permet de rejeter un grand pourcentage de possibilités.
Entrez les options suivantes dans une boîte ou une autre forme sur l'organigramme, qui identifie la forme des bactéries obtenues à partir de l'analyse microscopique de la coloration de Gram. Les types de formes sont des bâtonnets, des cocci, des sphères ou des ovoïdes, des spirilles, des tiges torsadées en spirale, des spirochètes, de très fines tiges torsadées à longues spirales, avec des bourgeons et des appendices et des parties filamenteuses. Les tiges et les cocci sont les plus communs. Le staphylocoque s'identifie comme un coccus.
Divisez les étapes, cases ou autres formes de choix suivantes en tests biochimiques pour chaque branche de l'organigramme. Ceux-ci diffèrent pour les différentes formes des groupements Gram. Le test principal pour les cocci à Gram positif est le test à la catalase utilisant du peroxyde d'hydrogène, et les options résultantes sont soit la catalase positive, soit la catalase négative. Par exemple, les espèces de Micrococcus et de Staphylococcus sont positives et celles de Streptococcus sont négatives. Des exemples d'autres étapes pour les groupes en dehors des non-coques, les non-Gram positifs comprennent la fermentation du lactose ou non pour les bâtonnets Gram négatif.
Analyser les propriétés de fermentation des bactéries dans l'élément suivant de l'organigramme. La bactérie fermente ou s'oxyde. Staphylococcus aureus est un agent de fermentation contrairement à Micrococcus, qui est oxydatif.
L'analyse de la fermentation est une étape courante pour l'identification des bactéries Gram-positives et Gram-négatives.
Ajouter une autre ligne et forme à la organigramme Cette étape représente un test de coagulation, un test biochimique appelé coagulase. Staphylococcus aureus produit l'enzyme coagulase, et lorsqu'il est testé avec un milieu approprié, il en résulte un caillot ressemblant à de la gelée. Tous les autres staphylocoques testés en tant que coagulase négative.
D'autres étapes pour d'autres groupes de bactéries comprennent le test d'oxydase pour les bâtonnets Gram négatif, ou la fermentation lente ou lente du lactose.